2020年1月26日，國家生物信息中心/國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心收錄由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所提供的5株2019新型冠狀病毒全基因組序列。這是自2019年12月新型冠狀病毒肺炎爆發(fā)以來，國內(nèi)公共數(shù)據(jù)平臺首次公開發(fā)布數(shù)據(jù)。
從今年1月以來，陸續(xù)有30余株2019新型冠狀病毒的基因組序列被國內(nèi)外科學(xué)家破譯，絕大部分?jǐn)?shù)據(jù)都遞交到由德國建立的全球流感序列數(shù)據(jù)庫（GISAID）系統(tǒng)。從該數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)獲取數(shù)據(jù)需要注冊賬號并經(jīng)過審核，獲得權(quán)限的研究人員才可登錄系統(tǒng)瀏覽數(shù)據(jù)，并且只能單個下載基因組序列。這就造成了中國產(chǎn)生的數(shù)據(jù)需要先出口再入口的使用模式和現(xiàn)象，而且數(shù)據(jù)下載十分繁瑣費(fèi)時。
國家生物信息中心/國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心一直致力于構(gòu)建國家級組學(xué)數(shù)據(jù)存儲與共享公共平臺，力爭第一時間為國內(nèi)乃至全球科學(xué)家提供基因組數(shù)據(jù)優(yōu)質(zhì)便捷的存管用服務(wù)。此次疫情爆發(fā)后，新型冠狀病毒信息庫（https://bigd.big.ac.cn/ncov）于2020年1月22日正式上線，一直保持全球最新、最完整的該病毒基因組數(shù)據(jù)發(fā)布動態(tài)，持續(xù)為國內(nèi)外科研人員提供方便快捷的數(shù)據(jù)檢索及下載資源。本次發(fā)布的5株2019新型冠狀病毒基因組序列的序列號為GWHABKF00000000、GWHABKG00000000、GWHABKH00000000、GWHABKI00000000、GWHABKJ00000000，相關(guān)項目編號為PRJCA002165。以上序列可在國家生物信息中心/國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心的項目庫或者冠狀病毒序列庫檢索并下載，無需注冊或向數(shù)據(jù)遞交者申請。
我們呼吁全國的科研衛(wèi)生機(jī)構(gòu)在第一時間把2019新型冠狀病毒基因組序列遞交到國家生物信息中心/國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心存儲共享，為該病毒的科研和防控提供數(shù)據(jù)支撐。
責(zé)編：微科普